特殊染色指除了HE染色之外的其他染色方法。包括以下几种：

1、Masson染色：masson染色是指用两种或三种阴离子染料混合，胶原纤维呈蓝色，肌纤维呈红色。用来显示组织中纤维以及炎性因子的染色方法之一。

2、天狼猩红染色： 天狼猩红是一种强酸性阴离子染料，可与呈碱性的胶原反应，使胶原纤维在偏振光照射时，产生明显的双折光现象。

3、甲苯胺蓝染色：又称为TB染色，它能够清楚地显示软骨形态潮线等结构，观察软骨组织是否有损伤。

4、油红O染色：油红O为脂溶性染料，在脂肪内能高度溶解，可特异性的使组织内甘油三酯等中性脂肪着色。

5、PAS染色：又称过碘酸雪夫染色，糖原染色。在组织学上主要用来检测组织中的糖类。过碘酸把糖类相邻两个碳上的羟基氧化成醛基，再用Schiff试剂和醛基反应使呈现紫红色。

6、VG染色：利用不同阴离子染料混合或先后作用而完成鉴别染色。不同分子量大小的阴离子染料可以跟组织内渗透性大小不同的成分选择性地结合，从而把不同组织成分显示出来。

7、Von kossa染色：钙结节的形成为成骨细胞特有，Von kossa染色法是染色矿化结节的经典方法，利用硝酸银与钙盐的复分解反应形成可被还原的银盐，在强光或紫外光下或者强还原剂作用下使其还原为黑色的金属银。

8、Nissl染色：又称为尼氏染色，能够较好的显示尼氏体的状态。神经元细胞核周含有尼氏小体，当神经元受刺激后，胞体内的尼氏体即显著减少甚至消失。尼氏体的存在和消失反应神经细胞是否受损害。可作为观察神经细胞损害程度的一种灵敏指标。

9、番红O-固绿染色（软骨）：可直观反映关节软骨、软骨下的骨组织结构，软骨呈红色，成骨呈绿色，对比鲜明，区分清晰，在关节软骨及软骨下骨的形态学研究中备受青睐。

1、Masson染色：脱蜡至水—ZGSJ过夜-铁苏木素染色-丽春红酸性品红-磷钼酸染色-苯胺蓝染色—脱水封片—masson染色片（胶原纤维呈蓝色或绿色，肌纤维、纤维素和红细胞呈红色）。

2、天狼猩红染色：脱蜡至水-天狼猩红染色-酒精脱水-封片-天狼猩红染色片（光学显微镜下胶原纤维红色，背景黄色）。

3、甲苯胺蓝染色：脱蜡至水—甲苯胺蓝染色—脱水封片—甲苯胺蓝染色片（脑组织尼氏体呈深蓝色，背景淡蓝色；骨组织软骨呈紫蓝色，背景浅蓝色）。

4、油红O染色：冰冻切片晾干-油红染色-分化-苏木素染色-分化-返蓝-甘油明胶封片-油红O染色片（脂质呈橘红色至鲜红色，细胞核呈蓝色）。

5、PAS染色：脱蜡至水-PAS染色-脱水封片- PAS染色片

6、VG染色：脱蜡至水-VG染色-分化-酒精脱水-封片- VG染色片

7、Von kossa染色：脱蜡至水-von kossa染色-脱水封片- Von kossa染色片（钙盐沉积区域呈黑色或棕黑色，细胞核呈蓝色，背景呈红色；或者钙盐沉积区域呈黑色或棕黑色，背景呈红色）。

8、Nissl染色：脱蜡至水-尼氏染色-脱水封片-尼氏染色片（神经元内的尼氏小体呈深蓝色颗粒，细胞核呈淡蓝色，背景淡蓝色。）

9、番红O-固绿染色：脱蜡至水—固绿染色—番红染色—脱水封片-番红O-固绿染色片（成骨呈绿色，软骨呈红色）。

石蜡切片常温运输；固定后细胞爬片4℃运输；冰冻切片-20℃运输。

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